A Faculdade de Medicina possui uma área construída superior a 20 mil m². O complexo é dividido em Ala Nobre e Ala Nordeste, conjunto de pavilhões e biblioteca. O imóvel conta, ainda, com três prédios anexos e pátios.
- Ala Nobre: possui 4.350 m² e está assentada na área mais antiga do imóvel. No pavimento superior estão o Salão Nobre, Sala da Congregação, Sala dos Lentes, Memorial da Medicina Brasileira, salas da diretoria, do setor administrativo e secretarias. No térreo, funciona o Museu Afro Brasileiro e, no subsolo, o Museu de Arqueologia e Etnologia da UFBA.
- Ala Nordeste: área de 2.400 m², com pavilhão de salas para aula e espaços para projetos, além do Anfiteatro Alfredo Britto.
- Biblioteca Gonçalo Muniz: possui área de 1.800 m² e um acervo valioso de obras raras, livros, documentos e teses, perfazendo mais de 100 mil volumes. Imóvel e acervo estão em processo de restauração, com recursos do Ministério da Saúde. As obras no imóvel são executadas pela Escola Oficina de Salvador. Na Fameb, já funciona um laboratório para restauro dos documentos.
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